कुछ समय के लिए जिंस बाजारों में सबसे अधिक इस्तेमाल किए जाने वाले संदर्भ बिंदु क्या आरोप के अधीन रहे हैं। बहुसंख्यक ऑपरेटर उन्हें कृत्रिम आंदोलनों के लिए हेरफेर के अधीन मानते हैं, जो बेंचमार्क को अपारदर्शी बनाते हैं, चाहे वह तेल हो या धातु। लिबोर (लंदन इंटरबैंक रेट) के कुछ प्रबंधकों और कीमती धातुओं पर फिक्सिंग को कटघरे में लाने वाली घटनाएं सर्वविदित हैं। ठीक उसी तरह जिस तरह से ईंधन संकेतक कीमतों को संसाधित करने वाली पद्धतियों की कुछ समय के लिए आलोचना की गई है, विशेष रूप से ब्रेंट दिनांक जो मैकग्रा-हिल की अध्यक्षता वाली विशेष एजेंसी प्लैट्स द्वारा दैनिक रूप से प्रकाशित की जाती है।
हाल के दिनों में, हालांकि, एक रिपोर्ट तैयार की गई थी, जिसे आज लॉ फर्म क्लाइड एंड कंपनी द्वारा प्रकाशित किया गया था, जिसके अनुसार पूछताछ किए गए 64 ऑपरेटरों में से 170% ने बेंचमार्क सेट करने के लिए इस्तेमाल की जाने वाली विधियों की आलोचना की होगी। विधियाँ जो बहुत अधूरी हैं, बहुत प्रतिनिधि नहीं हैं, हेरफेर करना आसान है, पूरी तरह से स्वतंत्र नहीं हैं। ट्रस्ट इसलिए विफल हो जाता है, जबकि साजिश के सिद्धांत कृत्रिम रूप से उद्धरणों को स्थानांतरित करने के लिए बढ़ते हैं।
कीमतों के संकेत में पारदर्शिता की कमी के संदेह से प्रभावित वस्तुएं कई हैं। प्रश्न चिह्न कोयला, लौह अयस्क, उर्वरक, प्राकृतिक गैस, तेल, कुछ धातुओं पर केंद्रित है। इसके अलावा, कई ऑपरेटर, कम से कम 30% साक्षात्कारकर्ता, उस शुद्धता के प्रति आश्वस्त हैं जिसके साथ बेंचमार्क विस्तृत किए गए हैं और संतुष्टि के साथ उनका उपयोग करते हैं। तथ्य यह है कि यूरोपीय आयोग ने वित्तीय और कमोडिटी बेंचमार्क के लिए नए नियम प्रस्तावित किए हैं।
उन्हें प्रशासित करने वालों को अधिकृत और पर्यवेक्षण के अधीन होना चाहिए और वास्तविक लेन-देन पर गणना पद्धति का आधार होना चाहिए न कि उन अनुरोधों और प्रस्तावों पर जो वास्तविक बिक्री या खरीद का नेतृत्व नहीं करते हैं। हालांकि, बाद की परिकल्पना को क्रू ग्रुप (कमोडिटीज रिसर्च यूनिट) के निदेशक निक एडवर्ड्स ने चुनौती दी है: "यदि कीमतों को तय करने के लिए लेन-देन ही एकमात्र आधार था, तो भौतिक बाजारों पर, विशेष रूप से कम तरल वाले पर प्रतिकूल प्रभाव पड़ेगा"।
