Johnson & Johnson sedang diselidiki atas aktivitas yang bertentangan dengan aturan pasar, karena dianggap mampu menempati posisi dominan di sektor kedokteran, farmasi, dan ortopedi. Komisi Eropa sebenarnya telah membuka penyelidikan terhadap perusahaan AS atas rencananya untuk mengakuisisi Synthes Inc, sebuah perusahaan Swiss yang aktif di bidang biomedis, dan menggabungkannya ke dalam raksasa AS. Komisi UE menjelaskan bahwa penyelidikan bergantung pada fakta itu merger semacam itu “akan mempertemukan dua pemasok terkemuka instrumen dan peralatan bedah tulang belakang, memperkuat posisi Synthes sebagai pemain terdepan dalam industri peralatan kraniomaksilofasial dan memperkuat posisi Johnson & Johnson di sektor ortopedi”.
Oleh karena itu, Komisi Eropa mengungkapkan "kekhawatiran" tentang kemungkinan merger antara kedua perusahaan tersebut. Bahkan, dikhawatirkan bahwa pesaing lain yang beroperasi di pasar referensi "mungkin tidak dapat menjalankan aktivitas yang cukup kuat" pada tingkat ekonomi dan persaingan. Selanjutnya, menurut Komisi UE, "penghapusan salah satu pemain utama dari pasar dapat berdampak negatif dari sudut pandang inovasi". Dan tugas Komisi justru “untuk memastikan bahwa itu benar mempertahankan persaingan nyata dan memelihara inovasi, satu-satunya yang dapat menjamin perawatan yang memadai untuk semua pasien” di Uni Eropa, Joaquin Almunia menggarisbawahi, wakil presiden Komisi Eropa. Pembukaan investigasi, Brussel memberi tahu kami, "tidak memengaruhi hasil akhir" yang sama, tetapi bagaimanapun Komisi UE akan melanjutkan selama 90 hari, "hingga 19 Maret 2012" ketika akan mengeluarkan putusannya.
Investigasi juga sedang dilakukan terhadap Johnson & Johnson oleh Antitrust Eropa atas dugaan pelanggaran aturan pasar terkait analgesik Fentanil, yang dituduhkan perusahaan AS telah membayar pesaingnya untuk mencegah akses ke pasar Belanda.
